核酸报告是如何诞生的 ( 2022-03-21)
前面几天,经历了第一批“网格化”筛查的市民发现,有些小区已经重新进入“决赛圈”,有些研判下来还是有风险的,则延长了管控时间。其中起到关键作用的,是一份份核酸报告。
对于市民来说,核酸检测看似只有两步:登记采样,等待数小时后在健康云App上查询结果。事实上,在这看似轻松的两步背后,还凝聚了基因扩增实验室(PCR实验室)检验人员的大量工作。
采样后,你的样本经历了怎样的“奇幻漂流”之旅?新民晚报记者走进同济大学附属东方医院南院检验科PCR实验室,吴文娟主任为大家揭秘一份准确的核酸报告是如何诞生的。
标本拥有了“身份证”
“医生,我今天在你们医院做的核酸什么时候有结果呀?还要多久呀?”
“医生,我急需核酸报告,能加急帮我检测一下吗?”
这几天,申城各医疗机构的医务人员总会接到这样的问询电话。很多人以为,核酸采样后,直接用机器检测很快就能出结果了。其实,从采样护士在你的鼻部或咽部“轻捻慢拢”后,后续还包括了样本签收、核酸提取、核酸转移、核酸扩增、结果审核等步骤。
核酸检测样本采集后,采集人员会清点数目,并用密封袋包装好,用消毒剂喷洒消毒,然后放进样本转运箱,由专人送到核酸检测实验室。检测人员收到样本后会先对转运箱消毒,并在开启后对转运箱内壁和标本采集密封袋二次消毒,之后才是拆开密封袋取出样本。
“核酸的采集管上都有条码信息,签收人员要理清样本来自哪一个社区或人群,是单采还是混采。”吴文娟表示,“另外,我们还会留意样本上的时间,便于日后需要时回溯。”
之后,核酸样本就将经历“奇幻漂流”的第二步——要有“身份证”啦!检验人员则将这一步称为“样本前处理”。“PCR反应是在96孔板上实现的,每一个孔位都有自己独一无二的身份。”吴文娟说。
看似只是“前处理”,但防备之心可是一点儿也不能松。检验人员要识别空管或溢洒情况的发生。尤其在大人群10:1混采时,小小的试管被拭子挤满,一旦阳性样本出现了溢洒,一方面可能造成其他样本结果的污染(假阳性),另一方面对实验室的生物安全产生威胁——这也是PCR实验室的检验人员同样要穿成“大白”模样的原因——医用帽子、N95口罩、面屏、护目镜、医用防护服、隔离衣、一次性鞋套、两层手套,这些“束缚”却能给检验人员创造最安全的环境。
此外,PCR实验室要求严格分区,最好是负压实验室。空气流动只会从外向内,那么实验室里的污染就不会扩散到外界,可以保证实验室外面的安全。
与病毒“擦肩而过”或只有2毫米
拿到“身份证”的核酸样本并不能直接测试,而是要先提取核酸,对其进行扩增。因此,核酸样本“奇幻漂流”的下一站,是PCR加样区——简单来说,检验人员要把病毒的遗传物质(核糖核酸)给“揪出来”。
此时,检验人员戴着双层手套,在生物安全柜内一管一管地拧开螺旋盖,手工吸取样本,加入核酸提取板孔中,再拧上螺旋盖将标本放回原处。“有多少份样本就有多少次的重复操作。”吴文娟说。那时,检验人员与新冠病毒“擦肩而过”的距离可能只隔着两层乳胶手套——也就是2毫米,但核酸检测工作不允许他们害怕。
获得核酸后,检验人员用移液枪将核酸转移至事先准备好反应液的反应管里,制成反应体系,让它进入“奇幻漂流”的下一站:扩增分析区。
“不能出错,不能有遗漏,不能发生生物安全事故。可以说检验人员全身时刻处于高度紧张的状态。就单说‘加样’,检验人员要用极小的枪头将每个提取好的核酸,大概是一滴水的四分之一加入到试剂中,每一步操作都必须十二分谨慎。”吴文娟告诉记者,“我们迫切希望能有开盖、加样的仪器来‘解放’检验人员,可现有的仪器在速度上并不能令人满意,遇上大样本筛查只能靠手工操作。”
让它变多才能检测出来
经历了复杂费时的前期制备过程,样本终于来到了“奇幻漂流”的关键一站。样本的采样质量如何、核酸提取的质量如何、结果如何都将在此处见分晓。
这里不得不提一下曾斩获诺贝尔奖的聚合酶链反应(PCR),这是20世纪80年代中期发展起来的一项体外核酸扩增技术,它可以将目标基因片段于数小时内扩增百万倍至数亿倍,成为当今生命科学研究最为重要且广泛使用的技术手段之一。
怎么理解扩增?
如果把样本提取出来的核酸看作是一块土地,新冠病毒是种子,如何知道土地里有没有种子?简单的方法是,加点水和肥料(试剂),让种子一个变两个、两个变四个、四个变八个……“病毒是看不到的,而且微量样本也不容易检测到,所以要让它变多,才方便检测出来。”吴文娟解释。
经过复杂的前期制备工作,才能在PCR仪上进行扩增检测。上机后,就是历时约1.5小时扩增检测,而且中间不能有停顿、不能有断电、不能有仪器故障,核酸检测才能完成。
当反应管在机器上开始检验后,也就意味着“开弓没有回头箭”——从采样到核酸制备任何一个环节出现问题都可能导致返工重测,从而使报告时间加倍。
3月15日,国家卫健委发布《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第九版)》。其中,《方案》将解除隔离管理和出院标准修改为“连续两次新型冠状病毒核酸检测N基因和ORF基因CT值均≥35(荧光定量PCR方法,界限值为40,采样时间至少间隔24小时)”,这也让很多“小白”知道,这儿的“CT”并非到医院拍个CT,而是指扩增的阈值。“简单来说, CT值越低,说明阳性越强;CT值越高,说明阳性越弱。”
作为初筛实验室,只能向疾控中心报告“疑似阳性”。“我们会将CT值登记报告,上报相应区域的疾控部门。随后根据疾控的要求转运原管标本以供复核。”吴文娟说,而PCR实验室也会通过紫外线消毒。据介绍,通常阴性样本会储存一两天以备查验。
向你飞奔而来的报告背后是汗水
走到这,核酸样本的“奇幻漂流”之旅并没有结束。检测人员需要对扩增结果进行分析:包括同批随样本检测的阴阳性质控结果是否在控、基线设置、逐孔分析内标及样本结果是否正常等。当阴阳性质控全部符合检测要求,排除假阴性、假阳性可能,对异常结果样本及时进行复核,确保无误后才能最终报告结果,并上传到健康云。
有人好奇,健康云核酸结果查询里,“OFR1a/b阴性,N基因阴性”是什么意思?吴文娟解释,这是新型冠状病毒核酸的两个特异性片段,“一般同一份标本中两个基因检测结果均为阳性,会判断为阳性,单基因阳性则需复检。”
“现在我们检验科的工作包括了‘愿检尽检’——市民需要核酸阴性报告这张‘通行证’的;‘应检尽检’——住院患者和陪护,还有医院承担的密接、次密接及高风险人群的核酸检测。这几天,还有网格化筛查的任务。”吴文娟的语气里透露着疲惫。
那仪器运行时,检测人员能轻松一会儿吗?并不是,此时,新的一批样本又来了,又要开始录信息,提核酸,加样……吴文娟说,随着核酸样本量不断增大,检验人员一直是在超负荷运转。
“防护服是不透气的,全身罩在里面,刚穿上就会很热。加之机器一刻不停,热量积聚一天后整个实验室会非常闷热,即使开着空调室内温度也会达到28-30℃。此外,实验室里静电也很强烈,因此也特别干燥。”她说,“我们中的很多人已经连续几天都没有回过家了,大家都是‘5+2’‘白+黑’的节奏在工作,能够躺下来休息一会,就觉得很满足了。”
摘自新民晚报微信公众号
原文链接:http://wsjkw.sh.gov.cn/crbfz/20220321/1f7241fbe17f4ae5b42de9586805e642.html
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